迄今发现的密码子共64种，能编码氨基酸的密码子共61种，另3种为终止密码子。tRNA上不存在与mRNA上的终止密码子配对的反密码子。按Crick于1966年提出的变偶假说，反密码子的第一位碱基与密码子的第三位碱基的配对可以在一定范围内变动（变偶），如U可以和A或G配对，G可以和U或C配对,但A和C只能分别与U和G配对。
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